229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3529 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3529  hydrolase  100 
 
 		 220 aa  448  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.52 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.10706  normal  0.0227644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3478  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.25 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  33.99 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1711  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  33.51 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0940062  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  34.13 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5694  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  33.02 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  30.69 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  31.86 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  32.69 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7580  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.59 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.38 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.15 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.93 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.68 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1752  HAD family hydrolase  24 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000718269  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  24.74 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.13 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2403  HAD family hydrolase  26.91 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000854479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  24.74 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  21.52 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  24.41 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.75 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  22.32 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2565  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000244874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  20.98 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1575  HAD family hydrolase  23.29 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000310395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.92 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  22.82 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  23.04 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.42 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  19.59 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  28.08 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  25.95 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  25.79 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.64 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.32 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  24.17 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.32 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  22.75 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  22.16 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  22.33 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  24.63 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  22.92 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  23.19 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0705  HAD family hydrolase  28.18 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.27 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  21.32 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.22 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  21.84 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.4 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  22.77 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.52 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  23.47 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  27.32 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  23.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.17 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1917  phosphatase  22.49 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  23.94 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.18 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  25 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  24.42 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  25.83 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  24.14 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  23.47 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  22.99 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  23.47 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.82 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  24.17 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  21.39 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.27 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  23.47 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  20.1 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.18 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  24.89 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  23.04 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  23.83 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.12 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  21.86 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  23.98 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.34 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  26.77 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  23 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.29 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4573  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.62 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  31.01 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  22.94 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>