189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2202 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  331  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2536  hypothetical protein  47.2 
 
 
182 aa  124  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  36.11 
 
 
163 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  32.92 
 
 
173 aa  90.9  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  33.94 
 
 
164 aa  90.5  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  32.34 
 
 
196 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  34.72 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  34.97 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  36.02 
 
 
163 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  34.27 
 
 
199 aa  87.4  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  36.02 
 
 
163 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0053  hypothetical protein  29.41 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0051  hypothetical protein  29.41 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  32.93 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1339  hypothetical protein  35.17 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3114  hypothetical protein  35.17 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  35.17 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  33.95 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  29.29 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  28.31 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  30.14 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  31.43 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  27.78 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  29.93 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  31.21 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  29.45 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  29.25 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  30.71 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  30.71 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  30.34 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  29.92 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  29.79 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  26.57 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  29.92 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  27.4 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  29.92 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  29.92 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  29.92 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  33.1 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.39 
 
 
241 aa  64.3  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  32.52 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  29.92 
 
 
215 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  30.82 
 
 
234 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  26.95 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  29.45 
 
 
230 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  29.45 
 
 
230 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  29.45 
 
 
230 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  26.21 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  29.45 
 
 
230 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  29.45 
 
 
230 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  29.45 
 
 
230 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  29.45 
 
 
230 aa  62.4  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  29.45 
 
 
230 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  29.45 
 
 
230 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  29.84 
 
 
218 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  27.89 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  31.25 
 
 
232 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  25.85 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  27.94 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  27.15 
 
 
235 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  27.78 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  27.04 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  27.33 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  27.33 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  30.4 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  28.77 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  32.65 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  26.39 
 
 
242 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  25.34 
 
 
230 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26.06 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  27.66 
 
 
242 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  27.21 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  26.95 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  26.76 
 
 
232 aa  58.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05430  predicted membrane protein  43.55 
 
 
209 aa  58.2  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.054004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  27.4 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  26.95 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  26.95 
 
 
230 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  25.53 
 
 
147 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  26.95 
 
 
230 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  29.86 
 
 
226 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  20.57 
 
 
232 aa  57.8  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  28.86 
 
 
188 aa  57.4  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  26.14 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2961  membrane protein-like  30.07 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  28.12 
 
 
243 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  27.97 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1758  hypothetical protein  29.32 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  28.93 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  27.78 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  22.58 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  29.58 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  26.43 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  22.86 
 
 
224 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  25.71 
 
 
149 aa  54.7  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  20.57 
 
 
232 aa  54.7  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  25.87 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>