63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0569 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0569  YceI family protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  29.83 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  28.18 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  30.82 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  28.38 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  30.14 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  29.73 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  29.73 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  29.45 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  29.05 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  26.35 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  29.17 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  28.76 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  28.76 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  27.93 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0433  YceI family protein  29.7 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0486569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  27.93 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  28.08 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  25.66 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  26.35 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  25.68 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  25.68 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  25 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  25 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  40.91 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  28.12 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  28.95 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  24.68 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  23.65 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  27.34 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  24.69 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  26.62 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  24.31 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  29.41 
 
 		 420 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  24.35 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  30.15 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  26.87 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  25.81 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  27.03 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  26.62 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  27.81 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  35.38 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  29.63 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  30.86 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  26.61 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  24.38 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  27.5 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  28.36 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  29.79 
 
 		 196 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  33.33 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  33.33 
 
 		 219 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  38.71 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  29.73 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  28.43 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  28.86 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4883  YceI family protein  21.14 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.831843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  30.1 
 
 		 285 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  35.63 
 
 		 236 aa  40.8  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>