119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3289 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  100 
 
 		 236 aa  458  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  60.8 
 
 		 221 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  53.89 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  52.91 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  41.78 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  43.93 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  37.24 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  29.06 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0167  hypothetical protein  30.19 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  32.67 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1395  YceI family protein  30.08 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187267  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  32.21 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  30.65 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  33.33 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  36 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  36 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0433  YceI family protein  41 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0486569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  29.93 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  35 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  28.91 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  33.86 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4883  YceI family protein  30.5 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.831843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  32.47 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  35.9 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  31 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  30.25 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  30.89 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  31.93 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  31.93 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  37.35 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  35.45 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  35.92 
 
 		 179 aa  52  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.25 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34.19 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  37.35 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  37.35 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  28.46 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  33.01 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  37.35 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  37.35 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  37.35 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  37.35 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  37.35 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  37.35 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  37.04 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  36.14 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  33 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  33 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  33 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  30.23 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  30.89 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  27.34 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  37.18 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  37.18 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  37.18 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4138  YceI family protein  25.56 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  27.64 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  24.85 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  37.18 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  37.18 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  25.6 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  30.77 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  33.86 
 
 		 183 aa  48.5  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  31.65 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  31.09 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  34.57 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  34.44 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7356  YceI family protein  25.15 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  28.23 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  35.9 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  38.61 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.23 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.16 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  28.46 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  31 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  27.64 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  28.68 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  37.5 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  37.18 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  34.78 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  31 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.26 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  33.66 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  32.33 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  31.9 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  35.9 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  31.19 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  28.16 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  37.62 
 
 		 183 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  31.29 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  33 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  33.59 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  31.75 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  35.14 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  32 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  31.72 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  33.66 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  33.59 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>