45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3479 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  100 
 
 		 269 aa  527  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  80.51 
 
 		 275 aa  411  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  49.5 
 
 		 223 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  44.19 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  34.27 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  31.82 
 
 		 195 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  29.3 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  31.05 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  32.6 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  32.21 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  35.29 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  26.19 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  25.54 
 
 		 191 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  32.56 
 
 		 184 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  25.54 
 
 		 191 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  25.54 
 
 		 191 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  25.54 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  32.58 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  27.32 
 
 		 196 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  28.12 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  27.88 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  25.54 
 
 		 191 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  25.54 
 
 		 191 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  25.54 
 
 		 191 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  24.04 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  28.03 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  25.95 
 
 		 189 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  29.93 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  25.34 
 
 		 191 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  27.33 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  26.67 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  23.57 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  39.44 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  26.71 
 
 		 191 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  28.68 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  27.67 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  24.03 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  32.29 
 
 		 184 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  26.92 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  26.67 
 
 		 182 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  28.91 
 
 		 192 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  28.28 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  35.62 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  34.71 
 
 		 187 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  27.13 
 
 		 201 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>