79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2969 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  32.73 
 
 		 267 aa  85.9  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  32.34 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  34.55 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  34.1 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  37.24 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  31.45 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  31.82 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  29.89 
 
 		 275 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  28.66 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  31.29 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  31.21 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  27.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  27.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  25.15 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  27.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  27.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  27.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  27.17 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  27.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  27.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3103  hypothetical protein  23.16 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  27.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  29.45 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  33.01 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  27.33 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  27.33 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  26.9 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  31.05 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  23.98 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  31.71 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  26.72 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  30.61 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  26.72 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.08 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  32.43 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  25.82 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  25.82 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  25.82 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  29.19 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  29.46 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  25.27 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  25.82 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7356  YceI family protein  28.67 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  30.87 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  26.97 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  29.9 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  33.33 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  27.59 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  29.03 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  28.12 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  22.91 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  28.05 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  40.68 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  33.59 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  28.12 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  26.28 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  23.89 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  28.57 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  25.24 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  25.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  23.89 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  27.5 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  23.89 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  25.15 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  24.86 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  24.84 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  32.14 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  24.34 
 
 		 196 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  22.49 
 
 		 192 aa  42  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  24.47 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  27.89 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  31.25 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  27.53 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  24.03 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>