85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0504 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  33.97 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  31.05 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  32.47 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  31.58 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  32.73 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  28.8 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  28.26 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  28.26 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  29.05 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  27.84 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  26.11 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  25.54 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  28.57 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  25.15 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  26.59 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0053  YceI family protein  27.56 
 
 		 198 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  25.27 
 
 		 202 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  26.63 
 
 		 190 aa  52.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  29.19 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  29.19 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3103  hypothetical protein  32.48 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  27.08 
 
 		 177 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  26.71 
 
 		 186 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  25.75 
 
 		 198 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  25.95 
 
 		 199 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  31.3 
 
 		 176 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  25.17 
 
 		 189 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  28.48 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  30.53 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4883  YceI family protein  30 
 
 		 185 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.831843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  23.76 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  24.62 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  25.62 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  25.75 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  27.11 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  27.62 
 
 		 182 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  26.56 
 
 		 178 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  27.49 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  24.85 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  25.41 
 
 		 183 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  26.53 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  24.66 
 
 		 186 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  25.64 
 
 		 191 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  25.64 
 
 		 191 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  24.66 
 
 		 186 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  25.64 
 
 		 191 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  25.64 
 
 		 191 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  25.64 
 
 		 191 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  25.64 
 
 		 191 aa  45.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  25.64 
 
 		 191 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  25.64 
 
 		 191 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  45.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  22.06 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  25.64 
 
 		 191 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  24.66 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  24.43 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  25.81 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  24.66 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  25.41 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  24.28 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  23.03 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  26.52 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  26.52 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  25.27 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  32.58 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  25.74 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  25.69 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  24.08 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  26.14 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  27.47 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  25.52 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  25.49 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  22.64 
 
 		 194 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  24.14 
 
 		 200 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  27.6 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  27.6 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  27.6 
 
 		 191 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>