29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0502 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  100 
 
 		 260 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  46.46 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  44.19 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  42.65 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  34.78 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  34.55 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  31.68 
 
 		 183 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  35.29 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  33.94 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.45 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  29.25 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  30.87 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  31.58 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  29.22 
 
 		 209 aa  48.9  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  26.71 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  26.47 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  29.21 
 
 		 187 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  26.85 
 
 		 191 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  26.85 
 
 		 191 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  26.85 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  26.85 
 
 		 191 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  29.05 
 
 		 190 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  25.61 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1635  YceI family protein  40 
 
 		 186 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  24.82 
 
 		 191 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  29.53 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  24.04 
 
 		 191 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  31.36 
 
 		 212 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  27.86 
 
 		 192 aa  42  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>