58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2124 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  48.1 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  47.49 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  41.78 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  40.24 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  43.2 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  31.45 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  29.36 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  31.58 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  28.48 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  28.68 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  29.77 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  29.77 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  29.77 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  29.14 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  31.61 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  29.23 
 
 		 189 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  30.46 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  32.1 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  27.39 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0432  YceI family protein  31.13 
 
 		 198 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0053  YceI family protein  26.88 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  30.97 
 
 		 181 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  25.62 
 
 		 200 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  33.33 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  29.37 
 
 		 183 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  28.89 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  28.21 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  29.71 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  27.67 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0167  hypothetical protein  27.01 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  33.59 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  29.31 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  33.54 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  27.86 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  39.47 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  30.82 
 
 		 421 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  33.65 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  25.2 
 
 		 196 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  33.81 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  32.54 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  23.85 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3103  hypothetical protein  27.18 
 
 		 192 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  31.06 
 
 		 212 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  28.12 
 
 		 179 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  28.68 
 
 		 176 aa  42  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  26.71 
 
 		 191 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  27.4 
 
 		 191 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>