26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0167 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0167  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  357  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0065  hypothetical protein  39.52 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4138  YceI family protein  40.49 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6393  YceI family protein  37.06 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0349  hypothetical protein  36 
 
 
185 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.716786  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3300  YceI family protein  32.74 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.607855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0225  YceI family protein  37.21 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202963  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  30.19 
 
 
236 aa  62  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  32.63 
 
 
229 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  26.21 
 
 
221 aa  48.5  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  28.09 
 
 
246 aa  48.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  24.77 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  27.01 
 
 
246 aa  44.7  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0053  YceI family protein  25.84 
 
 
198 aa  44.7  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  36.84 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  36.84 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  36.84 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  36.84 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4883  YceI family protein  35 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.831843  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  36.84 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  35.53 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  35.53 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.2 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  34.21 
 
 
193 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  22.31 
 
 
241 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1395  YceI family protein  22.73 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187267  normal  0.0429317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>