187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0053 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0053  YceI family protein  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4883  YceI family protein  30.34 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.831843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0583  hypothetical protein  34.39 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1395  YceI family protein  30.29 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187267  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3147  hypothetical protein  34.59 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3260  YceI family protein  34.97 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3338  YceI family protein  34.27 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  32.9 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  30.86 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2164  YceI family protein  27.22 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  35.58 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  27.75 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  38.71 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  28.57 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0432  YceI family protein  25.47 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  25.56 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  29.17 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  27.52 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  29.68 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  31.67 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  32.26 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  27.52 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0433  YceI family protein  26.16 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0486569  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  25.53 
 
 		 420 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  24.26 
 
 		 416 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  30.94 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  30.41 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  28.8 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  24.84 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  25.6 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  33.06 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  35.48 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.38 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  29.69 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  26.7 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  26.7 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  24.02 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  25.52 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  24.02 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  24.02 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  24.02 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  32 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  37.66 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  27.05 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  23.46 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  29.69 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  27.92 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  30.77 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  33.01 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2233  YceI family protein  26.86 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466697  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  30.6 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  31.45 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  33.33 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  27.36 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  27.08 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  26.76 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  33.01 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  23.93 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  26.21 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  28.66 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  33.01 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  31.09 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  22.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  31.86 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  29.51 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  23.42 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  23.42 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  23.42 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  27.63 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  28.57 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  25.48 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  31.15 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  31.15 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  28.23 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  35 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  22.44 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  36.71 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  33.64 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  25.32 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  34.07 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  29.17 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  31.15 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  22.47 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  28.69 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  32.97 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  28.8 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  24.81 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  35.44 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  26.09 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4193  YceI family protein  31.78 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>