22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0432 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0432  YceI family protein  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0433  YceI family protein  36.82 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0486569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1780  hypothetical protein  31.41 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3265  YceI family protein  27.18 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1781  hypothetical protein  30.13 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9033  hypothetical protein  33.54 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0053  YceI family protein  25.47 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11918  hypothetical protein  29.17 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2592  hypothetical protein  35.87 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  25 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1166  hypothetical protein  36.08 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0292  YceI family protein  37.89 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  27.98 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2273  YceI family protein  22 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.322488  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  31.13 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  32.35 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  26.22 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  26.22 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0569  YceI family protein  20.94 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1635  YceI family protein  30.19 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3103  hypothetical protein  27.93 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  27.08 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>