21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0433 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0433  YceI family protein  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0486569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0432  YceI family protein  38.92 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1778  hypothetical protein  25.7 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  37.25 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  41 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0569  YceI family protein  29.7 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9033  hypothetical protein  33.9 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3265  YceI family protein  25.83 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1780  hypothetical protein  28.3 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0053  YceI family protein  26.11 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1395  YceI family protein  27.16 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187267  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  36.36 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0292  YceI family protein  34.26 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  23.94 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0583  hypothetical protein  29.17 
 
 		 183 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 301 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11918  hypothetical protein  30.61 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1781  hypothetical protein  22.28 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2164  YceI family protein  27.54 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  33.8 
 
 		 246 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1166  hypothetical protein  29.29 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>