32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11918 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11918  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1166  hypothetical protein  60.77 
 
 
179 aa  227  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5164  hypothetical protein  55.81 
 
 
178 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0292  YceI family protein  44.89 
 
 
190 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2592  hypothetical protein  40.72 
 
 
178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1635  YceI family protein  34.27 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9033  hypothetical protein  32.16 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0090  YceI family protein  28.32 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108082  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0432  YceI family protein  29.17 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  24.75 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  27.11 
 
 
193 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  27.89 
 
 
191 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  30.11 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  31.33 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  31.52 
 
 
187 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  30.11 
 
 
182 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  31.18 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0433  YceI family protein  30.61 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0486569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  32.26 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  31.18 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  31.18 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  32.26 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  32.26 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  25.23 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  32.26 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  31.43 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  30.69 
 
 
183 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  33.33 
 
 
186 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  33.33 
 
 
186 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  26.71 
 
 
187 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  27.54 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  32.26 
 
 
207 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>