32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1635 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1635  YceI family protein  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9033  hypothetical protein  56.67 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11918  hypothetical protein  34.27 
 
 		 203 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0292  YceI family protein  32.93 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1166  hypothetical protein  35.84 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5164  hypothetical protein  34.1 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2592  hypothetical protein  31.48 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  27.08 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  27.08 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  30.07 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  28.12 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  33.67 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  29.41 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  37.37 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3115  YceI family protein  32.63 
 
 		 183 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0561184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  27.63 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  28.12 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  29.9 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  28.87 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  30.51 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  40 
 
 		 260 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  36.7 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  31.68 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  29.9 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  26.57 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  26.53 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  28.68 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  30.4 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0432  YceI family protein  29.11 
 
 		 198 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  28.72 
 
 		 195 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  25.58 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  31.31 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>