More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_41053 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_41053  predicted protein  100 
 
 
231 aa  478  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20015  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.75 
 
 
227 aa  250  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50761  D-ribulose-5-phosphate 3- epimerase  53.15 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06630  ribulose-phosphate 3-epimerase, putative  46.76 
 
 
224 aa  209  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07588  ribulose-phosphate 3-epimerase (AFU_orthologue; AFUA_2G15190)  46.12 
 
 
252 aa  208  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337987  normal  0.331774 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.51 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17265  predicted protein  50.76 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27529  hitchhiker  0.00915674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.75 
 
 
239 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.25 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.4 
 
 
224 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.4 
 
 
224 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.4 
 
 
224 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.92 
 
 
236 aa  188  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3557  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.09 
 
 
228 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.11 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.7 
 
 
235 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.04 
 
 
218 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.74 
 
 
217 aa  185  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 
218 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.66 
 
 
216 aa  184  7e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.09 
 
 
209 aa  184  8e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.47 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.91 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.54 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.74 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.52 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.52 
 
 
214 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.52 
 
 
214 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.52 
 
 
214 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.52 
 
 
214 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.52 
 
 
214 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.52 
 
 
214 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.98 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.58 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1994  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.78 
 
 
229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.83 
 
 
219 aa  181  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.95 
 
 
232 aa  181  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
214 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
230 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.12 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.62 
 
 
230 aa  181  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.15 
 
 
224 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.89 
 
 
229 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.24 
 
 
229 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
225 aa  180  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.89 
 
 
226 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.15 
 
 
236 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0856  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.74 
 
 
230 aa  179  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0271981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.82 
 
 
217 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.74 
 
 
238 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.01 
 
 
234 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.01 
 
 
234 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.66 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
221 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
227 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.22 
 
 
222 aa  178  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.44 
 
 
228 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
216 aa  177  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0924  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
231 aa  177  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.99 
 
 
227 aa  177  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.96 
 
 
243 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.44 
 
 
228 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 
234 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.66 
 
 
220 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.33 
 
 
225 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.44 
 
 
224 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
220 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.93 
 
 
225 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.91 
 
 
217 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.47 
 
 
219 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.63 
 
 
225 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 
225 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.53 
 
 
225 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
227 aa  175  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0350  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.34 
 
 
226 aa  175  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.027158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.3 
 
 
223 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0361  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.34 
 
 
226 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.2 
 
 
224 aa  175  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.2 
 
 
223 aa  174  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.53 
 
 
228 aa  174  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.74 
 
 
236 aa  174  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.89 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.64 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.26 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.28 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0103  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0118359  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.05 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.72 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>