More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4440 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4440  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0910  ABC transporter related  48.55 
 
 		 245 aa  228  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.175671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  43.64 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  42.67 
 
 		 238 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  42.19 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  43.1 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  45.27 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  40.85 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  40.17 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  41.27 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  40.17 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0008  ABC transporter related  43.51 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419449  hitchhiker  0.000235622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  38.71 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  41.08 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1654  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.611887 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  40.41 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  41.53 
 
 		 249 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  41.28 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  37.45 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1852  ABC transporter related  42.36 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231349  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  41.03 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  38.14 
 
 		 238 aa  185  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  41.1 
 
 		 234 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  41.95 
 
 		 236 aa  185  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  41.1 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  41.42 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  40 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  39.57 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  40.35 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  39.34 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  39.74 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  40 
 
 		 234 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 290 aa  181  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  39.57 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  38.98 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  36.89 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  41.03 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0510  ABC transporter related  38.03 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00193174  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  36.99 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  39.83 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  39.66 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  38.21 
 
 		 256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  39.24 
 
 		 245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  38.3 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  39.74 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4102  ABC transporter related  38.37 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  38.46 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  38.72 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  36.86 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  36.86 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  37.61 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  36.86 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.86 
 
 		 238 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  38.72 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  41.45 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3690  ABC transporter-related protein  39.57 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  39.15 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  36.86 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  36.86 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  36.86 
 
 		 238 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  37.29 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  38.46 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  41.1 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  37.18 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1138  ABC transporter related  40.08 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113733 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  38.46 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  40.09 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  38.3 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  39.74 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  38.46 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0899  ABC transporter related  40.43 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.98 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1976  ABC transporter related  38.24 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  38.98 
 
 		 241 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  38.98 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  37.02 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  36.6 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  37.02 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  38.3 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  36.02 
 
 		 235 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 238 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.98 
 
 		 241 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>