215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1852 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  100 
 
 		 278 aa  544  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  41.73 
 
 		 434 aa  175  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  37.54 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  37.59 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  36.2 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  30.18 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  38.08 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  35.71 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  31.69 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  32.74 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  36.73 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  35.4 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  35.25 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  34.41 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  34.75 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  32.35 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  34.17 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  33.21 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  33.81 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  29.68 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  36.73 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  33.33 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  35.46 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  34.91 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  35.23 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  35.23 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  33.82 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  31.99 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  32.39 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  34.91 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  33.78 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  32.75 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  32 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  31.33 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  36.47 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  32.64 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  30.85 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  31.9 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  35.31 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  29.18 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  32.86 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  30.8 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  32.28 
 
 		 584 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.62 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  37.02 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.55 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  30.93 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  32.2 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  31.91 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  31.91 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.39 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  30.07 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  30.42 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  33.57 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.62 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  31.56 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  30.28 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.14 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.77 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  32.06 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  32.38 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  32.53 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  32.38 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  32.05 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  31.83 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  29.08 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  31.71 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.67 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.43 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  35.8 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  32.5 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  32.5 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.98 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  29.79 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  33.1 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  30.99 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  28.17 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  29.63 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  24.39 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  34.42 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  28.07 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  29.63 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  27.14 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  28.32 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  24.24 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  30.86 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30.43 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30.43 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  38.86 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  24.48 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.43 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  30.51 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  36.15 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  28.99 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  29.12 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  30.11 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.08 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  28.87 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  27.18 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>