206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0788 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  48.22 
 
 
855 aa  722    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  49.59 
 
 
854 aa  714    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  48.52 
 
 
864 aa  681    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  49.16 
 
 
870 aa  717    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  47.44 
 
 
906 aa  690    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  100 
 
 
872 aa  1702    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  49.76 
 
 
854 aa  702    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  46.4 
 
 
858 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  47.72 
 
 
857 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  49.35 
 
 
856 aa  649    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  46.13 
 
 
903 aa  715    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  49.94 
 
 
843 aa  728    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  45.33 
 
 
898 aa  653    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  34.93 
 
 
804 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  37.1 
 
 
829 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  34.91 
 
 
827 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.4 
 
 
796 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  30.2 
 
 
796 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.71 
 
 
796 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  30.59 
 
 
796 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.96 
 
 
796 aa  399  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  35.65 
 
 
817 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.71 
 
 
796 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  35.85 
 
 
821 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  32.93 
 
 
821 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.96 
 
 
796 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  30.87 
 
 
796 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.75 
 
 
796 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.35 
 
 
796 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  34.98 
 
 
827 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  35.07 
 
 
803 aa  382  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  34.07 
 
 
783 aa  379  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  36.17 
 
 
789 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  36.44 
 
 
770 aa  363  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  34.86 
 
 
813 aa  360  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  34.99 
 
 
769 aa  358  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  34.76 
 
 
818 aa  357  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  32.17 
 
 
810 aa  350  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  33 
 
 
779 aa  345  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  31.33 
 
 
818 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  32.25 
 
 
822 aa  340  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  31.11 
 
 
819 aa  335  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  34.59 
 
 
787 aa  332  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  32.17 
 
 
806 aa  330  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  32.7 
 
 
809 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  32.4 
 
 
889 aa  324  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  30.47 
 
 
819 aa  321  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  29 
 
 
811 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  32.35 
 
 
809 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  33.05 
 
 
844 aa  314  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  31.49 
 
 
808 aa  310  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  28.96 
 
 
823 aa  300  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  27.65 
 
 
780 aa  298  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  30.14 
 
 
848 aa  295  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  31.82 
 
 
836 aa  290  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  31.59 
 
 
774 aa  289  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  32.62 
 
 
786 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  30.68 
 
 
807 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  32.77 
 
 
821 aa  278  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  29.86 
 
 
847 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  29.66 
 
 
847 aa  271  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  31.19 
 
 
839 aa  270  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  30.77 
 
 
837 aa  269  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  25.95 
 
 
795 aa  268  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  27.25 
 
 
810 aa  266  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  27.38 
 
 
807 aa  260  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  30.35 
 
 
812 aa  257  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  30.64 
 
 
792 aa  257  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  30.7 
 
 
827 aa  256  9e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  31.05 
 
 
833 aa  253  9.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  29.06 
 
 
816 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  29.82 
 
 
847 aa  252  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  29.77 
 
 
809 aa  248  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  28.39 
 
 
824 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  28.52 
 
 
824 aa  247  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  35.09 
 
 
641 aa  243  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  29.42 
 
 
809 aa  243  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  29.42 
 
 
809 aa  243  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  28.29 
 
 
823 aa  241  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  28.94 
 
 
795 aa  241  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  28.39 
 
 
823 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  28.83 
 
 
782 aa  235  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  32.09 
 
 
818 aa  234  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  27.94 
 
 
761 aa  230  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  31.2 
 
 
785 aa  230  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2302  peptidase S45 penicillin amidase  26.07 
 
 
831 aa  229  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  30.52 
 
 
762 aa  226  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  30.26 
 
 
774 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.95 
 
 
821 aa  224  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  29.26 
 
 
795 aa  224  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  30.01 
 
 
813 aa  222  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  26.82 
 
 
874 aa  221  3.9999999999999997e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  27.65 
 
 
795 aa  221  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  31.87 
 
 
947 aa  220  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  31.4 
 
 
947 aa  220  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  28.15 
 
 
829 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  29.33 
 
 
813 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  31.05 
 
 
947 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  28.26 
 
 
803 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  29.56 
 
 
813 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>