More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1658 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
263 aa  548  1e-155  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  49.03 
 
 
265 aa  286  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  50.37 
 
 
265 aa  275  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  46.46 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  41.22 
 
 
247 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  44.26 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  40.31 
 
 
269 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 
236 aa  140  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
221 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  35.65 
 
 
263 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  38.98 
 
 
220 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
214 aa  135  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 
232 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 
262 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  35.91 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.11 
 
 
349 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 
251 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 
348 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  38.42 
 
 
335 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 
349 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 
253 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  36.9 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32.06 
 
 
339 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 
242 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  32.97 
 
 
624 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.9 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  35.06 
 
 
616 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 
354 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 
220 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  38.56 
 
 
196 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 
276 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
251 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  35.2 
 
 
279 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
230 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.44 
 
 
217 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.34 
 
 
286 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
227 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 
269 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  35.98 
 
 
284 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
255 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.81 
 
 
244 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 
254 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 
243 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 
293 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  27.19 
 
 
234 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
179 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
311 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
217 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
311 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 
228 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  32.74 
 
 
553 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  35.56 
 
 
671 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  28.73 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  33.91 
 
 
311 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
876 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  34.59 
 
 
629 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 
671 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 
671 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.78 
 
 
664 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.18 
 
 
270 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 
241 aa  95.5  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  28 
 
 
223 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  30.49 
 
 
652 aa  92.8  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
229 aa  92  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  32.08 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  32.08 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 
236 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  32.08 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  31.1 
 
 
652 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 
281 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  30.11 
 
 
209 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
182 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  31.15 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  28.63 
 
 
219 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
335 aa  89  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 
263 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  30.77 
 
 
600 aa  87  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 
182 aa  86.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  32.72 
 
 
613 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  32.72 
 
 
613 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  32.72 
 
 
613 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  33.14 
 
 
282 aa  85.9  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  38.62 
 
 
219 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>