More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0916 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  528  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  43.08 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  39.16 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  46.29 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  42.7 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  39.02 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 268 aa  202  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  36.8 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  39.92 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  40.16 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  42.05 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  44.35 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  39.85 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  35.74 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  36.26 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  37.83 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  41.46 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  36.74 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  36.57 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  38.2 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  40.82 
 
 		 255 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 268 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  35.69 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  39.16 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  37.31 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  35.61 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  41.96 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  39.31 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  35.88 
 
 		 269 aa  184  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  38.34 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  36.8 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  41.94 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  41.52 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  37.96 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  37.26 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  35.66 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  41.96 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.8 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  36.5 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  35.36 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.8 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  37.12 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  37.8 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  36.06 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 273 aa  178  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  37.75 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  36.43 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  37.92 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  35.43 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  38.68 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  36 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  36.36 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  35.04 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  39.06 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  35.36 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  38.4 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  34.48 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  42.04 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  36.78 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 279 aa  174  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  35.96 
 
 		 271 aa  174  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>