More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0325 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  51.54 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  50.33 
 
 		 165 aa  141  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  42.66 
 
 		 148 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  41.5 
 
 		 148 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  38.73 
 
 		 155 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  42.67 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  40.94 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  43.79 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  43.79 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  46.81 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  42.76 
 
 		 152 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  39.13 
 
 		 155 aa  119  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  43.79 
 
 		 153 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  39.46 
 
 		 149 aa  118  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  37.41 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  36.73 
 
 		 149 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  36.73 
 
 		 149 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  36.05 
 
 		 149 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  39.01 
 
 		 145 aa  112  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  44.74 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  37.78 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  38.89 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  33.33 
 
 		 144 aa  105  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  40.28 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  37.41 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  38.89 
 
 		 153 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  33.8 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  34.69 
 
 		 176 aa  96.3  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  33.8 
 
 		 174 aa  94.7  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  34.72 
 
 		 151 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  33.81 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  33.09 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  36.72 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  30.77 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  32.14 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  33.11 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  33.55 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  32.86 
 
 		 122 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 123 aa  62  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 122 aa  62  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1859  30S ribosomal protein S13  31.76 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  32.14 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  30.2 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  32.86 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  32.14 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  32.86 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  31.33 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  32.39 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  30.32 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  30.57 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  30.71 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  33.57 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  32.14 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  30.71 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  32.86 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  30 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3274  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000858241 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  31.94 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2927  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  29.29 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  32.39 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  31.76 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>