127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0315 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  100 
 
 
313 aa  625  1e-178  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  35.24 
 
 
322 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  30.82 
 
 
338 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  30.65 
 
 
327 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  30.12 
 
 
321 aa  122  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  30.82 
 
 
330 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  30.84 
 
 
290 aa  122  9e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  32.4 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  29.7 
 
 
328 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  33.23 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  31.21 
 
 
316 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  27.49 
 
 
432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  28.07 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  28.07 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  32.86 
 
 
301 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  30.82 
 
 
276 aa  106  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  33.81 
 
 
289 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  27.3 
 
 
313 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  31.21 
 
 
289 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  27.72 
 
 
314 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  31.27 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  26.42 
 
 
735 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  32.38 
 
 
328 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  27.4 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  28.2 
 
 
316 aa  92.4  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  28.57 
 
 
292 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  26.28 
 
 
286 aa  85.9  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  24.02 
 
 
900 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  29.47 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  27.53 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  25.86 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  26.25 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  28.62 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  25.62 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  24.29 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  26.81 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  24.92 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  26.5 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  31.69 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  27.06 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  24.56 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  31.54 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  24.21 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  28.62 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  26.3 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  24.92 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  29.11 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  24.36 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  26.3 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  24.15 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  24.15 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  29.25 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  27.65 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  26.32 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  24.6 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  21.76 
 
 
356 aa  65.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  27.98 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  22.95 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  25.77 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  23.92 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  25.43 
 
 
388 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  25.42 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  25.42 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  28.96 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  25.25 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  23.39 
 
 
351 aa  59.3  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  24.93 
 
 
383 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  24.14 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  22.68 
 
 
779 aa  55.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  22.8 
 
 
387 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  25.68 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  24.55 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  21.9 
 
 
391 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  26 
 
 
360 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  22.68 
 
 
382 aa  53.1  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  21.68 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  36.11 
 
 
307 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  23.89 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  23.55 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  25.08 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  33.09 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  33.09 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  26.56 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  21.92 
 
 
359 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  25.08 
 
 
322 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  24.93 
 
 
383 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  23.31 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  23.31 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  24.78 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  25.17 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  20.18 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  23.68 
 
 
388 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3793  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.76 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  25.63 
 
 
348 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  22.76 
 
 
387 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  31.78 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  23.21 
 
 
359 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  23.53 
 
 
383 aa  46.6  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  23.53 
 
 
383 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  25.48 
 
 
380 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>