More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3929 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
386 aa  771    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3845  FAD dependent oxidoreductase  48.14 
 
 
381 aa  342  7e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  41.05 
 
 
404 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3868  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
402 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0943449  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 
392 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3020  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393882  normal  0.050284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
385 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
382 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
388 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 
381 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
401 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  22.97 
 
 
382 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
394 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 
400 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
385 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
395 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
392 aa  99.8  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
388 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.18 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
819 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0636  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188486  normal  0.91294 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 
373 aa  96.7  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
815 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
817 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.26 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
398 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
385 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2102  D-amino-acid dehydrogenase  30.23 
 
 
427 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
385 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 
812 aa  89.7  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.75 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
390 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
815 aa  86.3  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  28.21 
 
 
822 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  30.18 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 
500 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  26.74 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  25.28 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.07 
 
 
367 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  24.72 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
496 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  22.03 
 
 
799 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  24.44 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.44 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  24.44 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  24.44 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 
816 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  27.1 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
444 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  30.16 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.29 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 
816 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.13 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.83 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
815 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 
823 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.17 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  26.65 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
430 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 
365 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  23.91 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2883  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.27 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723496  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
492 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
843 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>