More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3478 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  100 
 
 
405 aa  792    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  67.7 
 
 
337 aa  432  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  60.47 
 
 
371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  60.27 
 
 
352 aa  370  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  43.62 
 
 
361 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  45.63 
 
 
336 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  47.91 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  48.08 
 
 
357 aa  208  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  49.48 
 
 
320 aa  196  7e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  37.02 
 
 
264 aa  163  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  38.26 
 
 
289 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  30.58 
 
 
277 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  36.33 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  32.59 
 
 
277 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  34.59 
 
 
272 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  30.94 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  30.94 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  30.94 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  30.94 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
277 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
277 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.94 
 
 
277 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  31.29 
 
 
277 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 
277 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  30.71 
 
 
276 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  36.84 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  32.17 
 
 
274 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  35.87 
 
 
280 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  31.7 
 
 
284 aa  139  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.1 
 
 
272 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  36.12 
 
 
277 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  32.06 
 
 
272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  30.66 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  30.94 
 
 
274 aa  136  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  33.08 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  33.08 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  35.55 
 
 
339 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.62 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.74 
 
 
310 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  27.9 
 
 
266 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
272 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  37.22 
 
 
297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  32.09 
 
 
268 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  29.37 
 
 
281 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.19 
 
 
285 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  33.83 
 
 
283 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.07 
 
 
308 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  29.71 
 
 
265 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 
269 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  25.64 
 
 
269 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  29.06 
 
 
280 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  33.07 
 
 
277 aa  123  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  32.97 
 
 
337 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  26.25 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  29.53 
 
 
277 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  29.12 
 
 
282 aa  120  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  28.74 
 
 
290 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  28.74 
 
 
290 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  24.62 
 
 
269 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  28.57 
 
 
285 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.84 
 
 
285 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  32.13 
 
 
289 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.37 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.46 
 
 
288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 
288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.46 
 
 
288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  34.01 
 
 
312 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  28.89 
 
 
304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  29.52 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  29.78 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  27.11 
 
 
277 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  27.72 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  30.51 
 
 
266 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  31.99 
 
 
310 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  31.72 
 
 
280 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  31.54 
 
 
293 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 
278 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  31.48 
 
 
301 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  26.22 
 
 
300 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  29.21 
 
 
288 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  29.41 
 
 
276 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  31.84 
 
 
276 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  25.47 
 
 
278 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.47 
 
 
279 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  25.47 
 
 
278 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  29.37 
 
 
267 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.47 
 
 
275 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  25 
 
 
272 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  28.52 
 
 
272 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  28.52 
 
 
272 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  27.95 
 
 
269 aa  103  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  25.19 
 
 
272 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  27.44 
 
 
287 aa  103  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  27.82 
 
 
271 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  28.15 
 
 
312 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  26.14 
 
 
269 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  26.72 
 
 
264 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.48 
 
 
269 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  28.9 
 
 
287 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>