More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4371 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 335 aa  651    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  74.84 
 
 		 320 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  63.11 
 
 		 306 aa  355  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  62.1 
 
 		 311 aa  348  9e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  62.14 
 
 		 303 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  53.15 
 
 		 317 aa  301  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  56.31 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  60.85 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  50.75 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  52.08 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  51.76 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 316 aa  255  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  48.59 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  49.69 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  49.52 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  55.13 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  50.32 
 
 		 312 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  50.64 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  55 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  46.31 
 
 		 354 aa  249  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  51.98 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  53.51 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  53.43 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  62.2 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  50.97 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  52.94 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  44.29 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  51.04 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  51.97 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  55.26 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 314 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 314 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  45.78 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  43.91 
 
 		 318 aa  219  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  42.44 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  40.65 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  39.55 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  40.65 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  43.73 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  37.85 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  40.5 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  40.82 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  40.51 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  41.4 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  40.81 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  40.88 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  44.25 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  37.74 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  37.81 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  39.17 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  37.99 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  40.38 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  41.35 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  40.91 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  42.35 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  37.99 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  37.34 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  40.57 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  41.99 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  39.87 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  35.78 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  38.64 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  40.06 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  44.74 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  40.57 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  37.01 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0710  porphobilinogen deaminase  41.59 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  39.81 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>