More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0793 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0793  ABC transporter related protein  100 
 
 
229 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.24 
 
 
236 aa  184  8e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.46 
 
 
233 aa  178  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  40.43 
 
 
232 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  37.5 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  42.27 
 
 
238 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  42.2 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  38.64 
 
 
236 aa  171  9e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 
244 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  40.45 
 
 
233 aa  169  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  41.74 
 
 
244 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  43.29 
 
 
255 aa  168  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  38.46 
 
 
232 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  40.18 
 
 
245 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  41.36 
 
 
236 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  36.48 
 
 
233 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  37.07 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  37.02 
 
 
233 aa  164  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
345 aa  164  9e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  36.75 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  38.03 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  42.27 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  36.49 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  39.46 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  34.2 
 
 
233 aa  162  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  36.32 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  39.21 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 
253 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2386  ABC transporter related  35.4 
 
 
229 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  37.44 
 
 
253 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  37.44 
 
 
253 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  35.5 
 
 
233 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  36.92 
 
 
238 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
245 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 
253 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
253 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
253 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  38.94 
 
 
234 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 
253 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
233 aa  159  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
253 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  40 
 
 
244 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
235 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  35.62 
 
 
266 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  40.27 
 
 
288 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  42.51 
 
 
266 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
253 aa  158  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
234 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  41.74 
 
 
255 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  35.16 
 
 
253 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  36.04 
 
 
230 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
253 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  34.21 
 
 
234 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  36.36 
 
 
248 aa  157  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.97 
 
 
269 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  34.04 
 
 
604 aa  157  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
302 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  35.62 
 
 
253 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 
255 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
253 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  36.64 
 
 
236 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  34.62 
 
 
234 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
256 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
235 aa  155  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  40.44 
 
 
226 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  37.62 
 
 
233 aa  156  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  39.09 
 
 
252 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  39.3 
 
 
238 aa  155  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
253 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  42.44 
 
 
225 aa  155  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  39.61 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2843  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  39.25 
 
 
245 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 
233 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
253 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  38.39 
 
 
243 aa  154  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.44 
 
 
233 aa  154  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  37.73 
 
 
241 aa  154  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 
252 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  38.76 
 
 
225 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  38.64 
 
 
247 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  42.38 
 
 
262 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  37.61 
 
 
234 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  40.98 
 
 
455 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  37.61 
 
 
234 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  40.67 
 
 
256 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40 
 
 
644 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  33.33 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  33.33 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  34.7 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  38.96 
 
 
236 aa  152  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  37.33 
 
 
238 aa  152  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1079  ABC transporter related  36.53 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  41.63 
 
 
245 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>