More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4343 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  100 
 
 		 279 aa  550  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.41 
 
 		 254 aa  358  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  69.32 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.77 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  70.28 
 
 		 597 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  69.88 
 
 		 597 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  69.88 
 
 		 597 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  66.67 
 
 		 264 aa  331  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.27 
 
 		 592 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.46 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  65.46 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  63.43 
 
 		 268 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.55 
 
 		 594 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  70.97 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.87 
 
 		 594 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  68.27 
 
 		 619 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  65.22 
 
 		 257 aa  325  6e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  63.47 
 
 		 274 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.49 
 
 		 595 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  64.75 
 
 		 267 aa  322  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  64.34 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  66.67 
 
 		 272 aa  322  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  68.25 
 
 		 602 aa  321  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  63.52 
 
 		 250 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  62.3 
 
 		 260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  62.7 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  62.7 
 
 		 250 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  68.44 
 
 		 636 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  68.44 
 
 		 636 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  68.44 
 
 		 636 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  68.44 
 
 		 636 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  62.01 
 
 		 598 aa  318  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  68.44 
 
 		 636 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  62.25 
 
 		 252 aa  318  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  63.5 
 
 		 636 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  65.46 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  61.35 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  65.6 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  64.26 
 
 		 274 aa  315  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.98 
 
 		 595 aa  315  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  61.48 
 
 		 260 aa  315  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  65.46 
 
 		 272 aa  315  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  62.77 
 
 		 636 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  60.8 
 
 		 253 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  63.27 
 
 		 256 aa  311  6.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  61.45 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  60.66 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  62.3 
 
 		 259 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  60.08 
 
 		 261 aa  304  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  62.25 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  60.24 
 
 		 256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  61.85 
 
 		 255 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  61.78 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  59.27 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  61.07 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  61.07 
 
 		 259 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  59.14 
 
 		 263 aa  298  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  60.08 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  57.43 
 
 		 256 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.47 
 
 		 254 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  57.43 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  56.45 
 
 		 254 aa  291  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  56.57 
 
 		 255 aa  291  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.2 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.78 
 
 		 263 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.6 
 
 		 581 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.59 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  57.26 
 
 		 256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  58.13 
 
 		 254 aa  281  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  60.25 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.02 
 
 		 240 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.5 
 
 		 263 aa  278  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  54.8 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  59.04 
 
 		 567 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.62 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.57 
 
 		 251 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.22 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.02 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  57.14 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  56.69 
 
 		 262 aa  271  7e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  54.22 
 
 		 265 aa  271  9e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.17 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.43 
 
 		 278 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  54.22 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  56.33 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.72 
 
 		 567 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  55.02 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  51.3 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.95 
 
 		 253 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  51.39 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2051  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.8 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.1 
 
 		 240 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  52.85 
 
 		 254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.61 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.73 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  52.4 
 
 		 255 aa  268  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>