More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1051 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 594 aa  1194    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  36.3 
 
 		 599 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  31.91 
 
 		 593 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  32.08 
 
 		 589 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  28.06 
 
 		 592 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  28.66 
 
 		 602 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  25.08 
 
 		 641 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  29.74 
 
 		 610 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  26.74 
 
 		 578 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  27.26 
 
 		 606 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  27.02 
 
 		 604 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  26.86 
 
 		 652 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 		 589 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  25.57 
 
 		 595 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  35.71 
 
 		 218 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  31.93 
 
 		 248 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  26.43 
 
 		 576 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  25.67 
 
 		 596 aa  105  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 		 574 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  35.47 
 
 		 239 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  25.6 
 
 		 589 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  24.21 
 
 		 596 aa  100  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  23.34 
 
 		 581 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  25.73 
 
 		 589 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  26.23 
 
 		 596 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  22.9 
 
 		 599 aa  96.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  30.08 
 
 		 226 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  23.32 
 
 		 612 aa  87.8  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 		 565 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  37.96 
 
 		 247 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  28.66 
 
 		 576 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  24.88 
 
 		 599 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  22.88 
 
 		 602 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  24.74 
 
 		 641 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  26.47 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  25.2 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  22.3 
 
 		 605 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  22.86 
 
 		 545 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  22.86 
 
 		 545 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  27.21 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  29.19 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  27.92 
 
 		 642 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  26.1 
 
 		 668 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  24.33 
 
 		 668 aa  73.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  22.24 
 
 		 712 aa  70.9  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  24.37 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  22.64 
 
 		 619 aa  70.9  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  22.16 
 
 		 735 aa  70.5  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  24.68 
 
 		 668 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  27.35 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  26.47 
 
 		 769 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  30.1 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  30.41 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  22.64 
 
 		 617 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  27.19 
 
 		 669 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  29.02 
 
 		 687 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  25.15 
 
 		 702 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  24.85 
 
 		 702 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  21.13 
 
 		 808 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  26.79 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  32.08 
 
 		 753 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  24.55 
 
 		 702 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  25.94 
 
 		 633 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  25.94 
 
 		 633 aa  62  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  22.05 
 
 		 713 aa  62  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  24.66 
 
 		 688 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  25.94 
 
 		 633 aa  62  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  25.94 
 
 		 633 aa  62  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  29.35 
 
 		 616 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  27.14 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  45.33 
 
 		 792 aa  61.6  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  26.01 
 
 		 613 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  27.8 
 
 		 611 aa  61.2  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  32.16 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  23.98 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  23.98 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  43.48 
 
 		 853 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  31.31 
 
 		 785 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  23.13 
 
 		 790 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  31.58 
 
 		 774 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  45.07 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  24.38 
 
 		 645 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  28.27 
 
 		 754 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  45.07 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 621 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  43.48 
 
 		 847 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  46.48 
 
 		 714 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  45.07 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  45.07 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  45.07 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  24.09 
 
 		 775 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  24.09 
 
 		 775 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  24.09 
 
 		 775 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  24.09 
 
 		 775 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  31.58 
 
 		 748 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  34.17 
 
 		 564 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  36.63 
 
 		 979 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  21.44 
 
 		 655 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  45.07 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>