More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0675 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0675  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 313 aa  628  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2800  hypothetical protein  35.86 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  31.11 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  25.76 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.2 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.2 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.2 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.2 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  24.54 
 
 		 340 aa  89.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.51 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.33 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.22 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  25.27 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.14 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.45 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  27.92 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1058  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1154  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569492  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.75 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  24.76 
 
 		 791 aa  76.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.51 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.32 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  23.42 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 777 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  42.39 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  29.05 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  30.33 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  24.28 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  32.87 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 791 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  33.1 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  32.87 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>