201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0382 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0382  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 611 aa  1219    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3690  glycoside hydrolase 15-related  80.03 
 
 		 593 aa  890    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00190476  normal  0.0841535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4858  glycoside hydrolase 15-related  56.68 
 
 		 597 aa  598  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1076  glycoside hydrolase 15-related  54.42 
 
 		 594 aa  585  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000337356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1183  glycoside hydrolase 15-related  54.86 
 
 		 616 aa  581  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2494  glycoside hydrolase 15-related  53.92 
 
 		 603 aa  558  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0307  glycoside hydrolase 15-related  52.14 
 
 		 583 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932548 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  30.91 
 
 		 850 aa  200  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  29.94 
 
 		 636 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  33.72 
 
 		 842 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  31.27 
 
 		 645 aa  197  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  32.11 
 
 		 599 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  32.99 
 
 		 786 aa  193  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  31.8 
 
 		 844 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  29.55 
 
 		 619 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  32.84 
 
 		 600 aa  192  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  32.5 
 
 		 847 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  28.46 
 
 		 677 aa  190  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  28.46 
 
 		 677 aa  190  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  28.46 
 
 		 677 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  30.73 
 
 		 602 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  28.92 
 
 		 679 aa  188  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  30.63 
 
 		 659 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  31.89 
 
 		 867 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  28.94 
 
 		 672 aa  187  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  28.69 
 
 		 642 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  31.35 
 
 		 645 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  29.13 
 
 		 635 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  28.46 
 
 		 668 aa  183  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  29.3 
 
 		 627 aa  181  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  30.76 
 
 		 602 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  30.66 
 
 		 602 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  30.92 
 
 		 600 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  28.53 
 
 		 662 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  30.12 
 
 		 639 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  31.28 
 
 		 597 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  29.29 
 
 		 636 aa  177  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  31.76 
 
 		 601 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  30.1 
 
 		 612 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  30.22 
 
 		 627 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  28.69 
 
 		 594 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  30.63 
 
 		 601 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  30.18 
 
 		 593 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  26.93 
 
 		 606 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  31.39 
 
 		 876 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  30.91 
 
 		 611 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  30.15 
 
 		 614 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  30.55 
 
 		 605 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  29.33 
 
 		 619 aa  170  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  30.13 
 
 		 601 aa  170  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  28.26 
 
 		 617 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  29.33 
 
 		 619 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  29.08 
 
 		 586 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  30.34 
 
 		 893 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  30.05 
 
 		 629 aa  169  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  30.36 
 
 		 604 aa  168  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  28.09 
 
 		 620 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  30.54 
 
 		 596 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  29.9 
 
 		 602 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  28.73 
 
 		 612 aa  167  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  28.02 
 
 		 595 aa  167  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  30.05 
 
 		 602 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  30.05 
 
 		 617 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  30.29 
 
 		 607 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  28.57 
 
 		 868 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  29.5 
 
 		 867 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  28.57 
 
 		 869 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  28.71 
 
 		 632 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  30.78 
 
 		 596 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  29.33 
 
 		 598 aa  163  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5896  glycoside hydrolase 15-related  31.35 
 
 		 609 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0215966 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  29.22 
 
 		 867 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  29.44 
 
 		 593 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  27.42 
 
 		 612 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  31.53 
 
 		 626 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  29.31 
 
 		 589 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  31.11 
 
 		 609 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  28.74 
 
 		 600 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  29.3 
 
 		 617 aa  161  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  28.26 
 
 		 608 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  28.01 
 
 		 629 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  30.23 
 
 		 616 aa  160  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1274  glycoside hydrolase 15-related  30.74 
 
 		 628 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.716617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  29.77 
 
 		 623 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  30.89 
 
 		 602 aa  158  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  31.47 
 
 		 626 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  27.47 
 
 		 595 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  29.37 
 
 		 598 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 605 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1434  glycoside hydrolase 15-related  29.11 
 
 		 616 aa  157  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  29.38 
 
 		 621 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  29.42 
 
 		 613 aa  156  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  30.15 
 
 		 598 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  30.35 
 
 		 609 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  30.28 
 
 		 609 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  30.35 
 
 		 609 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  29.22 
 
 		 596 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  29.15 
 
 		 623 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  29.64 
 
 		 596 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>