202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1183 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1183  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 616 aa  1234    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1076  glycoside hydrolase 15-related  87.48 
 
 		 594 aa  1038    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000337356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4858  glycoside hydrolase 15-related  54.19 
 
 		 597 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3690  glycoside hydrolase 15-related  55.63 
 
 		 593 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00190476  normal  0.0841535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0382  glycoside hydrolase 15-related  54.86 
 
 		 611 aa  545  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0307  glycoside hydrolase 15-related  52.61 
 
 		 583 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2494  glycoside hydrolase 15-related  52.43 
 
 		 603 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 		 600 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  31.24 
 
 		 629 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  31.01 
 
 		 620 aa  224  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  32.2 
 
 		 601 aa  224  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  33.9 
 
 		 598 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  31.69 
 
 		 594 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  30.79 
 
 		 662 aa  220  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  34.12 
 
 		 602 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  32.41 
 
 		 629 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  34.07 
 
 		 602 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  32.22 
 
 		 867 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  31.33 
 
 		 619 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  31.73 
 
 		 645 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  31.33 
 
 		 619 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  32.38 
 
 		 598 aa  217  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  33.68 
 
 		 597 aa  217  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  33.61 
 
 		 600 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  32.06 
 
 		 627 aa  216  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  30.72 
 
 		 612 aa  216  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  32.56 
 
 		 609 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  31.69 
 
 		 599 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  31.73 
 
 		 601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  31.2 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 602 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  32.65 
 
 		 586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 602 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  32.72 
 
 		 601 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  33.16 
 
 		 602 aa  213  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  31.63 
 
 		 617 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  29.38 
 
 		 672 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  29.5 
 
 		 668 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  31.4 
 
 		 786 aa  210  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  32 
 
 		 609 aa  210  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  31.81 
 
 		 611 aa  209  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  31.48 
 
 		 659 aa  209  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  31.16 
 
 		 844 aa  208  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  29.58 
 
 		 677 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  29.58 
 
 		 677 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  29.58 
 
 		 677 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  31.46 
 
 		 609 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  30.74 
 
 		 847 aa  207  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  29.8 
 
 		 642 aa  207  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  32.53 
 
 		 600 aa  206  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  31.6 
 
 		 628 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  31.51 
 
 		 609 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  31.13 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  31.51 
 
 		 609 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  32.27 
 
 		 603 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  31.71 
 
 		 597 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  29.12 
 
 		 608 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  30.66 
 
 		 636 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  31.07 
 
 		 614 aa  203  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  31.26 
 
 		 629 aa  203  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  29.25 
 
 		 619 aa  203  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  33.94 
 
 		 617 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  31.34 
 
 		 609 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  30.66 
 
 		 629 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  32.45 
 
 		 605 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  31.11 
 
 		 842 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  31.94 
 
 		 621 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  30.31 
 
 		 639 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  32.55 
 
 		 602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  29.67 
 
 		 850 aa  200  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  32.5 
 
 		 624 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  31.28 
 
 		 593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  30.67 
 
 		 605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  31.24 
 
 		 607 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 		 605 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 867 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  30.16 
 
 		 626 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  29.37 
 
 		 867 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  29.41 
 
 		 627 aa  195  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  29.84 
 
 		 635 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  30.87 
 
 		 601 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  33.11 
 
 		 596 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  31.17 
 
 		 610 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 610 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  31.19 
 
 		 592 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  31.17 
 
 		 610 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  31.17 
 
 		 610 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  31.17 
 
 		 610 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  31.17 
 
 		 610 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  31.17 
 
 		 610 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  30.67 
 
 		 665 aa  193  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  28.53 
 
 		 679 aa  194  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  31.87 
 
 		 592 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  30 
 
 		 598 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  32.44 
 
 		 596 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  33.28 
 
 		 604 aa  192  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  30.7 
 
 		 626 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  30.19 
 
 		 617 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  30.87 
 
 		 593 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0046  hypothetical protein  30.12 
 
 		 612 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>