201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5896 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1434  glycoside hydrolase 15-related  81.71 
 
 		 616 aa  1013    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1274  glycoside hydrolase 15-related  81.71 
 
 		 628 aa  1016    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.716617 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5896  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 609 aa  1228    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0215966 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  40.23 
 
 		 625 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  41.57 
 
 		 586 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.8 
 
 		 613 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  40.34 
 
 		 598 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  40.95 
 
 		 594 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  39.2 
 
 		 595 aa  372  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  41.01 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  41.47 
 
 		 602 aa  369  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  39.66 
 
 		 601 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  40 
 
 		 619 aa  360  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  37.52 
 
 		 612 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  38.82 
 
 		 612 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  40.03 
 
 		 605 aa  353  5.9999999999999994e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  40.17 
 
 		 598 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  38.72 
 
 		 596 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  38.74 
 
 		 623 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  40 
 
 		 594 aa  349  9e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  40.03 
 
 		 602 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  38.95 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  40.2 
 
 		 596 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  39.22 
 
 		 627 aa  347  4e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  38.82 
 
 		 627 aa  347  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  38.16 
 
 		 599 aa  347  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  37.96 
 
 		 613 aa  347  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  39.86 
 
 		 602 aa  347  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  38.88 
 
 		 623 aa  347  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  39.62 
 
 		 600 aa  346  7e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  37.5 
 
 		 599 aa  345  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  37.48 
 
 		 679 aa  342  8e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  37.79 
 
 		 610 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  39.87 
 
 		 617 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  38.79 
 
 		 645 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  39.12 
 
 		 594 aa  340  5e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  39.29 
 
 		 600 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  38.91 
 
 		 611 aa  339  7e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  39.26 
 
 		 621 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  34.22 
 
 		 606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  39.28 
 
 		 597 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  36.23 
 
 		 612 aa  335  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  40.17 
 
 		 596 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  38.32 
 
 		 617 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  38.44 
 
 		 626 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  38.7 
 
 		 603 aa  333  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  39.08 
 
 		 602 aa  333  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  38.01 
 
 		 617 aa  333  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  37.8 
 
 		 665 aa  332  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  38.88 
 
 		 609 aa  331  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  38.78 
 
 		 626 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  37.82 
 
 		 609 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  38.16 
 
 		 609 aa  329  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  37.48 
 
 		 611 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  38.59 
 
 		 593 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  38.8 
 
 		 602 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  38.2 
 
 		 598 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  37.65 
 
 		 617 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  35.9 
 
 		 608 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  38.66 
 
 		 605 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  39.36 
 
 		 616 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  37.99 
 
 		 609 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  37.99 
 
 		 609 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  38.03 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  37.09 
 
 		 628 aa  324  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  38.02 
 
 		 601 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  36.8 
 
 		 629 aa  324  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  36.62 
 
 		 636 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  38.31 
 
 		 613 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  36.3 
 
 		 636 aa  323  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  37.82 
 
 		 609 aa  323  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  36.05 
 
 		 677 aa  323  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  36.05 
 
 		 677 aa  323  8e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  37.5 
 
 		 626 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  35.4 
 
 		 619 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  38.58 
 
 		 624 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  37.44 
 
 		 605 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  35.1 
 
 		 868 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  36.84 
 
 		 621 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  35.89 
 
 		 677 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  37.5 
 
 		 598 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  35.36 
 
 		 608 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  35.61 
 
 		 662 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  33.28 
 
 		 696 aa  318  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  38.01 
 
 		 635 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  35.19 
 
 		 617 aa  317  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  35.58 
 
 		 894 aa  316  7e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  36.05 
 
 		 668 aa  316  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  36.22 
 
 		 672 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  36.85 
 
 		 611 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  38.03 
 
 		 645 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  35.95 
 
 		 635 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  37.37 
 
 		 601 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  37.63 
 
 		 608 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>