222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3120 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 284 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  88.13 
 
 		 281 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  51.69 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  51.69 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  51.69 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  47.47 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  40.31 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  37.25 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  41.67 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3107  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3167  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  32.84 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28 
 
 		 267 aa  95.9  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 254 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  26.64 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  26.64 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  26.64 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  26.64 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  26.64 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2830  ABC transporter, DrrB efflux protein  32.42 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2874  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.42 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2859  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.42 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  26.64 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 253 aa  92  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.64 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1754  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00326384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  26.23 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  26.23 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  25.41 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3736  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  25.6 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  36.15 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  27.71 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  29.04 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  27.49 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  30.49 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  26.33 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 293 aa  72  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.18 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4328  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  25.96 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  27.39 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3388  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.09 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3166  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.51 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>