More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1356 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
165 aa  328  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  91.52 
 
 
180 aa  300  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  88.27 
 
 
185 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  88.27 
 
 
185 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  87.65 
 
 
167 aa  286  7e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  84.24 
 
 
165 aa  284  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  79.25 
 
 
167 aa  261  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  70.81 
 
 
166 aa  216  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  56.88 
 
 
173 aa  187  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  60.38 
 
 
207 aa  183  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  56.88 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  59.75 
 
 
168 aa  180  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  53.12 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  52.83 
 
 
168 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  47.5 
 
 
170 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
181 aa  140  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  47.17 
 
 
167 aa  140  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  48.75 
 
 
179 aa  139  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  47.5 
 
 
166 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  48.43 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  49.06 
 
 
162 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  47.8 
 
 
173 aa  134  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  48.43 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  47.8 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  49.37 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  31.72 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  39.82 
 
 
171 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 
174 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
176 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
176 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
161 aa  52  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 
148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 
148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 
148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
140 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
138 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
171 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
180 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  31.85 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  46.84 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1179  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
141 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1196  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
141 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0286016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>