206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0185 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  764    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  64.81 
 
 		 403 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  64.59 
 
 		 383 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  63.76 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  64.49 
 
 		 406 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  64.49 
 
 		 406 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  64.23 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4416  major facilitator transporter  60.68 
 
 		 408 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  55.14 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  53.59 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  55.14 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  35.67 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.42 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  24.93 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  25.77 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0419  major facilitator transporter  25 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 452 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 440 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 400 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  27.52 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.61 
 
 		 485 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 440 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0414  fosmidomycin resistance protein  25.95 
 
 		 248 aa  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  27.14 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  25.32 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  27.14 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  27.14 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  27.14 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  25.32 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  25.32 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>