239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0611 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  100 
 
 
187 aa  376  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  55.49 
 
 
189 aa  214  7e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.11 
 
 
533 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.7 
 
 
538 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.54 
 
 
533 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  35.05 
 
 
534 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.03 
 
 
208 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.03 
 
 
208 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  34.72 
 
 
534 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.67 
 
 
534 aa  95.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.98 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.47 
 
 
534 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.31 
 
 
539 aa  92  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  34.04 
 
 
575 aa  91.3  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.21 
 
 
216 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.79 
 
 
202 aa  88.2  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.12 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  34.22 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.88 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  34.21 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  32.97 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  31.72 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.44 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  30.53 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  33.33 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.99 
 
 
533 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.24 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.03 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  31.87 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.24 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.24 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  31.87 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  30.85 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  30.05 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.41 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  33.16 
 
 
346 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  32.42 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  33.51 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  33.51 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  28.79 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  36.65 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  36.65 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  36.65 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  30.05 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  34.95 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  31.28 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  31.87 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  29.76 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  28.29 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  31.66 
 
 
539 aa  74.3  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  30.1 
 
 
216 aa  74.3  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  28.98 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  29.15 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  32.45 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  34.96 
 
 
546 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  33.51 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  34.92 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  29.38 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  30.81 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.69 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  32.75 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  31.18 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  31.72 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  26.27 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  29.02 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  26.55 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  31.97 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  29.02 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  34.22 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  30.29 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  34.22 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  26.98 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  27.18 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  32.81 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.21 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  31.15 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  28.04 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  30.77 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  26.86 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  24.87 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.9 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  28.19 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 
408 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  28.09 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  28.8 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  28.8 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  31.18 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  37.07 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  27.41 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  27.5 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  30.85 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  29.21 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  28.1 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4167  hypothetical protein  25.39 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  30.89 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.02 
 
 
197 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>