More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0179 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0179  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  739    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.732019  normal  0.13426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1144  ABC transporter related protein  56.68 
 
 		 373 aa  421  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.814209  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.34 
 
 		 1091 aa  133  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  27.27 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  27.91 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  28.34 
 
 		 493 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  27.79 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  27.79 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  27.13 
 
 		 491 aa  126  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  27.41 
 
 		 512 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  26.65 
 
 		 514 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  28.03 
 
 		 500 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  27.55 
 
 		 482 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  27.38 
 
 		 481 aa  122  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.62 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  26 
 
 		 497 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  27.38 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  26.25 
 
 		 510 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  26.48 
 
 		 501 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  28.74 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  26.11 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  24.7 
 
 		 483 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  25.89 
 
 		 537 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  26.04 
 
 		 470 aa  116  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  28 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  27.21 
 
 		 463 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  27.05 
 
 		 530 aa  112  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  25.45 
 
 		 471 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  27.21 
 
 		 548 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.02 
 
 		 502 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  26.94 
 
 		 509 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  26.21 
 
 		 477 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  26.4 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  23.97 
 
 		 531 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  25.95 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  24.49 
 
 		 481 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  24.71 
 
 		 502 aa  109  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  26 
 
 		 493 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  25.84 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  25.54 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  25.54 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  25.97 
 
 		 474 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  24.66 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  24.66 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  26.15 
 
 		 474 aa  103  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  24.61 
 
 		 764 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  26.51 
 
 		 568 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  25.79 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  26.62 
 
 		 456 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  24.95 
 
 		 482 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  24.21 
 
 		 488 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  26.41 
 
 		 491 aa  99.8  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  25 
 
 		 516 aa  99.4  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  24.84 
 
 		 541 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  25.49 
 
 		 469 aa  97.4  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  24.95 
 
 		 512 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  25.91 
 
 		 541 aa  95.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  24.78 
 
 		 492 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  25.26 
 
 		 574 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  26.17 
 
 		 510 aa  93.2  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  26.95 
 
 		 458 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  26.11 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  25.91 
 
 		 571 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  24.4 
 
 		 526 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  24.6 
 
 		 528 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  24.84 
 
 		 566 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.11 
 
 		 550 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.79 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  24.1 
 
 		 770 aa  85.5  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  23.97 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  23.97 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  24.38 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  31.58 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  32.04 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  25.29 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  22.58 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.07 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  24.57 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  26.01 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.37 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  24.63 
 
 		 558 aa  82.8  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0837  ABC transporter, ATP-binding protein  23.99 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1367  ABC transporter related protein  29.71 
 
 		 234 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.052808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.21 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  23.45 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  23.76 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.57 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  25.27 
 
 		 566 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.21 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  25.37 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  23.99 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  29.41 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  24.23 
 
 		 647 aa  80.5  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  25.45 
 
 		 944 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  23.95 
 
 		 535 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  22.95 
 
 		 543 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0173  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.06 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3872  ABC transporter related  24.75 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>