More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1925 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  100 
 
 		 146 aa  296  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  72.73 
 
 		 147 aa  218  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  75 
 
 		 159 aa  201  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  65.12 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  58.54 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  51.49 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  55.65 
 
 		 232 aa  133  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  50 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  45.61 
 
 		 202 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  40.16 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  41.88 
 
 		 205 aa  90.5  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  39.69 
 
 		 166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  39.69 
 
 		 166 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  38.17 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  39.69 
 
 		 166 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  38.17 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  39.2 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  47.37 
 
 		 202 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 165 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  44.55 
 
 		 516 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  43.36 
 
 		 510 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  44.25 
 
 		 499 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  44.25 
 
 		 499 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  37.78 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  40.83 
 
 		 217 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  46.32 
 
 		 203 aa  84  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  42.99 
 
 		 197 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 202 aa  83.6  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  43.01 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  42.59 
 
 		 520 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  42.59 
 
 		 520 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  42.59 
 
 		 516 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  38.28 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  41.67 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  41.67 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  41.67 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  41.67 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  42.16 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  43.56 
 
 		 479 aa  77  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  41.3 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  40.35 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  40 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  41.18 
 
 		 577 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.13 
 
 		 601 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  40.19 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  34.82 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  38.58 
 
 		 669 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  36.17 
 
 		 675 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  37.63 
 
 		 675 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.74 
 
 		 699 aa  67.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  38.26 
 
 		 481 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 251 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  33.06 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  34.51 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  36.94 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  36.17 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2870  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  40.82 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870199  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  36.73 
 
 		 407 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  29.23 
 
 		 773 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  33.87 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  34.31 
 
 		 391 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  34.94 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 274 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.58 
 
 		 440 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 712 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.86 
 
 		 1068 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.68 
 
 		 1055 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  30.4 
 
 		 698 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  39.58 
 
 		 463 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  36.46 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 728 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.08 
 
 		 689 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 721 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 721 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  37.25 
 
 		 338 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 694 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  34.86 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  38.39 
 
 		 429 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.18 
 
 		 433 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 587 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 509 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  33.61 
 
 		 439 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  31.2 
 
 		 437 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34 
 
 		 759 aa  57  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.09 
 
 		 726 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.36 
 
 		 852 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  32.76 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  31.48 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  35.45 
 
 		 476 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  32 
 
 		 708 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  32.77 
 
 		 439 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.08 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.92 
 
 		 427 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  36.14 
 
 		 513 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>