More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1838 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 500 aa  1023    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  41.14 
 
 		 486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 505 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 487 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 463 aa  189  9e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  29.36 
 
 		 467 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 507 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 502 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 504 aa  169  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  27.48 
 
 		 550 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  30.65 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 538 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 510 aa  160  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 550 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 527 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 518 aa  153  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 570 aa  153  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  29.69 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.29 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.29 
 
 		 473 aa  150  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  28.51 
 
 		 529 aa  146  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 540 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 516 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  27.5 
 
 		 529 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 457 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  30.64 
 
 		 503 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 		 394 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 369 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 395 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 381 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 385 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  33.84 
 
 		 386 aa  94.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 381 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 362 aa  92.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 		 348 aa  91.3  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 384 aa  91.3  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  33 
 
 		 372 aa  90.9  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 		 416 aa  90.9  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 412 aa  90.5  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 		 401 aa  90.5  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.35 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 371 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 395 aa  89.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  37.22 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 378 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 370 aa  87.4  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 440 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 		 374 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 660 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.42 
 
 		 745 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.51 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  27.24 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.08 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1603  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.535279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  27.78 
 
 		 822 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02955  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07860)  22.18 
 
 		 2880 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 678 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.12 
 
 		 407 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  30.53 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>