More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1603 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1603  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
335 aa  686    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.535279  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  47.35 
 
 
322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0277  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
373 aa  195  8.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0574  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
359 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.57518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
452 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  30.77 
 
 
471 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
500 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  35.02 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  28.74 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1435  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
377 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429378  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
355 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  27.27 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.81 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.17 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.48 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.69 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  28.69 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  26.64 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  27.83 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2006  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
377 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
414 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
414 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
414 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1449  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.860279  hitchhiker  0.0000879014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
821 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
421 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2124  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
389 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  26.72 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
378 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
819 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
822 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  27.42 
 
 
404 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.66 
 
 
404 aa  63.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
362 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
380 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
345 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
440 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
416 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
417 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
828 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  42.11 
 
 
384 aa  62.8  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
467 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
385 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  29.3 
 
 
395 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
821 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  27.59 
 
 
820 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3768  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1739  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
821 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
439 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
821 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
821 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
386 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
378 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
394 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  28.51 
 
 
383 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
378 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
450 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>