More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0277 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0277  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
373 aa  754    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  39.04 
 
 
322 aa  238  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1603  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 
335 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.535279  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0574  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
359 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.57518  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.27 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  31.46 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
904 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
500 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
403 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.51 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  35.92 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
406 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
412 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
360 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
1039 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
355 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
405 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 
405 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  26.46 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  25.5 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
377 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
355 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
440 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
455 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
366 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
376 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.43 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1402  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.59 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
355 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
364 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.15 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
440 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  30.39 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
753 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  26.52 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
421 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
428 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  24.02 
 
 
351 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
366 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 
445 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
348 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
351 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
421 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
382 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
375 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
409 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.13 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
772 aa  55.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>