179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5956 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5956  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 402 aa  771    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52704  decreased coverage  0.00676622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  37.67 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  37.07 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  37.63 
 
 		 370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 370 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  36.96 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.18 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 377 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  31.9 
 
 		 391 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0817  PepSY-associated TM helix domain protein  34.67 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3271  PepSY-associated TM helix  39.52 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  34.75 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2069  PepSY-associated TM helix domain protein  38.52 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3894  PepSY-associated TM helix domain protein  40.16 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1435  PepSY-associated membrane protein  41.6 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  35.28 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  35.01 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3008  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.87 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1737  hypothetical protein  37.7 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  34.29 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1877  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.03 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7043  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  38.02 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  34.37 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.07 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  26.28 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  26.83 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  25.59 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  26.76 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.99 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.3 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.68 
 
 		 533 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  24.94 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  24.26 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  27.22 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1117 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  28.03 
 
 		 519 aa  66.6  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  26.7 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.04 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  20.68 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  28.91 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.02 
 
 		 525 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  22.64 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  25.94 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  22.42 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  22.14 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.16 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  20.57 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  24.76 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.08 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  27.23 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  24.32 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  24.88 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  23.88 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.95 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  24.94 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  23.77 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  22.51 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  30 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.78 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  20.42 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  27.4 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.86 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  22.06 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  25.98 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  31.03 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.71 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.87 
 
 		 425 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  23.35 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.07 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  22.93 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.11 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  24.3 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  23.38 
 
 		 547 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  26.77 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.67 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  34.31 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  23.86 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  27.46 
 
 		 479 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.95 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.22 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  22.06 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  24.34 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  22.05 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  23.83 
 
 		 534 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.42 
 
 		 557 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.43 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  25.23 
 
 		 497 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.58 
 
 		 525 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1511  hypothetical protein  27.95 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  23.2 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.73 
 
 		 732 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  25.09 
 
 		 506 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.46 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  23.9 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.6 
 
 		 526 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  27.83 
 
 		 520 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  26.32 
 
 		 496 aa  53.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 559 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>