174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7043 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7043  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  100 
 
 		 377 aa  754    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3271  PepSY-associated TM helix  66.94 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3894  PepSY-associated TM helix domain protein  65.85 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  51.71 
 
 		 383 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  51.97 
 
 		 383 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  47.48 
 
 		 377 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  45.65 
 
 		 391 aa  328  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  46.68 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  48.25 
 
 		 370 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  48.25 
 
 		 370 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  47.98 
 
 		 370 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  48.52 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  44.47 
 
 		 396 aa  312  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1435  PepSY-associated membrane protein  51.64 
 
 		 376 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.58 
 
 		 386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0817  PepSY-associated TM helix domain protein  44.44 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  45.78 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2069  PepSY-associated TM helix domain protein  47.21 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3008  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  47.21 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1737  hypothetical protein  47.55 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  43.01 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  42.46 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1877  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.29 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5956  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52704  decreased coverage  0.00676622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  26.25 
 
 		 397 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  25.19 
 
 		 398 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  25.78 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  26.25 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  25.59 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  23.95 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  25.07 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  25.26 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  24.75 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  22.83 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.31 
 
 		 849 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.72 
 
 		 850 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  23.6 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  28.74 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  22.91 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.19 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.43 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  23.66 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.32 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  24.32 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  23.24 
 
 		 506 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.75 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.82 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2723  putative iron-regulated membrane protein  25 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.24 
 
 		 850 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.21 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  24.87 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.21 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  24.33 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.44 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.33 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.15 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  25.67 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  22.8 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.72 
 
 		 851 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  25.65 
 
 		 503 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  26.77 
 
 		 555 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.81 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.86 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  21.89 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  22.98 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.76 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  27.22 
 
 		 844 aa  60.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.4 
 
 		 575 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  23.59 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  20.17 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.49 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.65 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  28.17 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.53 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  26.17 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  28.17 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  28.17 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.35 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.32 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  23.18 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  24.49 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  25.52 
 
 		 539 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.28 
 
 		 540 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  24.72 
 
 		 487 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.45 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  23.97 
 
 		 538 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  27.34 
 
 		 840 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.27 
 
 		 530 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  25.52 
 
 		 539 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.82 
 
 		 525 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.24 
 
 		 529 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  23.43 
 
 		 627 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  23.94 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  21.77 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  24.82 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  25.56 
 
 		 542 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.52 
 
 		 539 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.25 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  22.16 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  22.18 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>