More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5951 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  48.2 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  49.09 
 
 		 227 aa  211  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  49.09 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 239 aa  211  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  48.64 
 
 		 227 aa  207  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  45.74 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  47 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  43.56 
 
 		 243 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 260 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 235 aa  98.6  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  35.6 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 290 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>