205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4431 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4431  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0309  putative PAS/PAC sensor protein  75 
 
 		 190 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.882882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  34.68 
 
 		 531 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 354 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  46.88 
 
 		 354 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4511  putative PAS/PAC sensor protein  38.97 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  34.76 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  41.24 
 
 		 539 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  42.71 
 
 		 345 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 491 aa  81.3  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  41.24 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 559 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  40.68 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  35.77 
 
 		 533 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  35.77 
 
 		 533 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  34.96 
 
 		 541 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  38.39 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  37.37 
 
 		 544 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 375 aa  77.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  33.61 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  33.61 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 814 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  35.2 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  42.27 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  38.14 
 
 		 544 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 901 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 503 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 		 812 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1292  putative PAS/PAC sensor protein  35.48 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 812 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  33.33 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 890 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  37 
 
 		 534 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2228  PAS domain-containing protein  31.17 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0904  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  37.11 
 
 		 507 aa  71.6  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0376  putative PAS/PAC sensor protein  42.57 
 
 		 408 aa  71.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000066026  normal  0.449331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  35.82 
 
 		 644 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  42.16 
 
 		 723 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 888 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  38.74 
 
 		 570 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40751  predicted protein  36 
 
 		 734 aa  70.1  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00189379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.37 
 
 		 929 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0896  sensor protein  36.79 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0812  putative PAS/PAC sensor protein  38 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  39.58 
 
 		 488 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 488 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 578 aa  68.2  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4613  putative PAS/PAC sensor protein  36.44 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 338 aa  68.2  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 913 aa  67.8  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.15 
 
 		 1021 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 369 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5559  hypothetical protein  38 
 
 		 342 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.0109335 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4629  sensory box protein  35.54 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0391  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 		 1040 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519884  normal  0.119604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4489  putative PAS/PAC sensor protein  35.54 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1231  LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0698119  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 581 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 		 760 aa  64.7  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 587 aa  63.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 922 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2986  PAS domain-containing protein  26.98 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1787  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  36.08 
 
 		 580 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 654 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1578  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 151 aa  62  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4032  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.93 
 
 		 1036 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4845  putative PAS/PAC sensor protein  32.08 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  32.29 
 
 		 463 aa  61.6  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  35.05 
 
 		 463 aa  61.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.19 
 
 		 1017 aa  61.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1820 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03435  GATA-factor [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7ZA36]  34.88 
 
 		 837 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_003296  RS03712  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1178 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433519  normal  0.713314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.04 
 
 		 1036 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2006  putative blue-light photoreceptor  39.13 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0395879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1000  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.745862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.64 
 
 		 836 aa  58.9  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15977  predicted protein  36.71 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 366 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51933  hypothetical protein  32.65 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 1877 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 959 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1429  sensory box protein  29.59 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0474  sensory box/GGDEF family protein  33 
 
 		 792 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3821  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  30.43 
 
 		 1209 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0235394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  30.43 
 
 		 1209 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1064 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15468  predicted protein  35.96 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.242872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  34.83 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2624  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.99 
 
 		 743 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366607  normal  0.0420324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>