252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3575 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  100 
 
 
395 aa  731    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  66.67 
 
 
389 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  66.76 
 
 
407 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  67.02 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  67.51 
 
 
389 aa  388  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  68.41 
 
 
388 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  50.68 
 
 
388 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  46.15 
 
 
394 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  45.07 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  43.27 
 
 
413 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  46.76 
 
 
394 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 
394 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 
397 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  43.79 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  43.79 
 
 
380 aa  253  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  43.5 
 
 
380 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  46.05 
 
 
375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  36.34 
 
 
392 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  37.83 
 
 
392 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  34.83 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  34.63 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
402 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
389 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  35.41 
 
 
387 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  34.84 
 
 
387 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  38.38 
 
 
377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  33.04 
 
 
381 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  32.72 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  31.99 
 
 
379 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  31.72 
 
 
379 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  31.72 
 
 
379 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
377 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  30.29 
 
 
386 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  34.51 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  30.56 
 
 
385 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  31.17 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30.99 
 
 
376 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  30.29 
 
 
385 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  30.56 
 
 
385 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  34.22 
 
 
382 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
381 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  30.55 
 
 
386 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  29.31 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  30 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  30 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  30 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  30 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 
418 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
383 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.68 
 
 
418 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.68 
 
 
418 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  27.87 
 
 
418 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  29.16 
 
 
404 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
436 aa  107  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  30.55 
 
 
386 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
392 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
386 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  24.72 
 
 
398 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  28.76 
 
 
389 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  28.76 
 
 
389 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  28.76 
 
 
389 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  28.76 
 
 
389 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  28.76 
 
 
389 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  28.35 
 
 
409 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  28.49 
 
 
389 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
388 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  31.29 
 
 
386 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  26.67 
 
 
398 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  27.99 
 
 
416 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  25.35 
 
 
398 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  25.35 
 
 
398 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  25.35 
 
 
398 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  24.44 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
398 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  24.44 
 
 
398 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  24.72 
 
 
398 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  24.44 
 
 
398 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  24.24 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  27.05 
 
 
429 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  27.87 
 
 
429 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  28.16 
 
 
385 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  27.85 
 
 
446 aa  90.1  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  27.78 
 
 
424 aa  89.4  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  24 
 
 
418 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  29.89 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  24 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.65 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  28.46 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  26.81 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  28.32 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  25 
 
 
447 aa  86.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  25 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  23.59 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  25.14 
 
 
444 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  24.71 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  27.34 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  27.04 
 
 
425 aa  84  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  28.95 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>