More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2095 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  100 
 
 
534 aa  1019    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  73.67 
 
 
533 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  56.76 
 
 
530 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  56.38 
 
 
531 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  58.44 
 
 
534 aa  541  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  52.76 
 
 
527 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  55.62 
 
 
532 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  53.33 
 
 
524 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  52.57 
 
 
535 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  53.61 
 
 
525 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  53.14 
 
 
531 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  54.67 
 
 
527 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  50.29 
 
 
545 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  46.79 
 
 
526 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
524 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  33.4 
 
 
534 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  41.59 
 
 
535 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  41.52 
 
 
541 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 
548 aa  310  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
554 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  40.3 
 
 
557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
548 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
548 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
548 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
548 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
548 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
548 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  40.15 
 
 
544 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
548 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  42.59 
 
 
537 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  42.59 
 
 
537 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  42.59 
 
 
537 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  40.95 
 
 
546 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  38.61 
 
 
548 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  39.32 
 
 
541 aa  292  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  40.76 
 
 
546 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  36.52 
 
 
539 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  40.87 
 
 
553 aa  291  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  39.55 
 
 
551 aa  290  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  39.55 
 
 
551 aa  290  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.1 
 
 
536 aa  289  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  40 
 
 
550 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  40.79 
 
 
555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  41.97 
 
 
549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  32.95 
 
 
528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  39.25 
 
 
553 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29.49 
 
 
529 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.04 
 
 
538 aa  279  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  33.52 
 
 
529 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 
529 aa  276  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  41.36 
 
 
565 aa  273  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  35.62 
 
 
541 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  36.9 
 
 
558 aa  269  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  30.68 
 
 
530 aa  263  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  40.22 
 
 
516 aa  261  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  35.85 
 
 
531 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  36.14 
 
 
548 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  34.17 
 
 
530 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.14 
 
 
531 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  38.76 
 
 
532 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.43 
 
 
529 aa  240  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  32.21 
 
 
523 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  38.08 
 
 
535 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  36.67 
 
 
535 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
520 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  35.67 
 
 
525 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  35.82 
 
 
525 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  36.38 
 
 
511 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  37.02 
 
 
530 aa  219  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.02 
 
 
555 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  35.24 
 
 
626 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.58 
 
 
641 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  31.63 
 
 
636 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.33 
 
 
634 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  34.13 
 
 
627 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  33.79 
 
 
625 aa  209  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  36.62 
 
 
554 aa  209  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.47 
 
 
644 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  32.14 
 
 
627 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.42 
 
 
639 aa  207  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.05 
 
 
659 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.7 
 
 
620 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 
622 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.81 
 
 
636 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  33.73 
 
 
625 aa  203  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.83 
 
 
634 aa  203  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  33.07 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  32.01 
 
 
640 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  33.2 
 
 
625 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  33.13 
 
 
627 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  31.87 
 
 
627 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  34.82 
 
 
542 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  31.4 
 
 
646 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0084  ABC transporter related  58.29 
 
 
209 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  34.94 
 
 
649 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  32.58 
 
 
638 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  33.53 
 
 
619 aa  200  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.93 
 
 
550 aa  200  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  32.96 
 
 
642 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>