More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1780 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  63.91 
 
 		 726 aa  905    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 726 aa  1459    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  62.62 
 
 		 743 aa  892    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  63.77 
 
 		 726 aa  903    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 		 860 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 815 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 		 736 aa  350  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 		 708 aa  350  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 		 734 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  35.65 
 
 		 714 aa  344  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 		 732 aa  342  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  34.54 
 
 		 850 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 825 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 825 aa  326  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 708 aa  326  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 711 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  32.27 
 
 		 708 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  32.17 
 
 		 703 aa  323  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 696 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.27 
 
 		 709 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 864 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 738 aa  318  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 		 741 aa  318  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  34.23 
 
 		 837 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  35.52 
 
 		 722 aa  317  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.77 
 
 		 696 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 689 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 		 817 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 703 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 709 aa  310  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 701 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 		 710 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  35.52 
 
 		 715 aa  308  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 710 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 862 aa  306  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.89 
 
 		 703 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 859 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.32 
 
 		 711 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 689 aa  299  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 730 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 		 843 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  33.56 
 
 		 755 aa  296  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 692 aa  289  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 710 aa  274  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 727 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 701 aa  264  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  30.33 
 
 		 703 aa  263  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 821 aa  260  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 792 aa  260  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 701 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 		 726 aa  259  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 701 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  30.13 
 
 		 801 aa  258  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 701 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 719 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 757 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 722 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  32.28 
 
 		 745 aa  253  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 799 aa  252  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 701 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 701 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  32 
 
 		 689 aa  250  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.17 
 
 		 752 aa  250  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 689 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 689 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 806 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  31.83 
 
 		 796 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 709 aa  248  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 698 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 721 aa  248  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 		 733 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 		 753 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 694 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 796 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 700 aa  243  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 796 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 747 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 794 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 		 707 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 744 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 796 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 707 aa  240  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 712 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 744 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 715 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 762 aa  237  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 722 aa  236  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 707 aa  236  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  30.12 
 
 		 747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  29.84 
 
 		 799 aa  236  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 829 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 829 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 710 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 770 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 771 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 		 750 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.58 
 
 		 713 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 706 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 750 aa  233  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>