More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0669 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2565  General substrate transporter  83.92 
 
 
436 aa  681    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0129523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2290  general substrate transporter  83.92 
 
 
436 aa  681    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.931887  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  84.63 
 
 
436 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  100 
 
 
438 aa  851    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  48.46 
 
 
443 aa  348  8e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  46.15 
 
 
473 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  41.94 
 
 
432 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 
439 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 
433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  44.66 
 
 
434 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1404  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1266  major facilitator family transporter  46.04 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1258  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 
434 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1862  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
426 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0383  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
438 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1100  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
438 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513292  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0766  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
438 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 
434 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2097  general substrate transporter  40.95 
 
 
424 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00320357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  40.55 
 
 
443 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  41.12 
 
 
443 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  41.12 
 
 
443 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  41.12 
 
 
443 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  41.15 
 
 
440 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55220  MFS family transporter  46.6 
 
 
438 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.872465  hitchhiker  0.00000012197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  42.69 
 
 
435 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  38.43 
 
 
442 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  41.9 
 
 
445 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  41.67 
 
 
445 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  37.26 
 
 
431 aa  285  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  41.67 
 
 
445 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  41.67 
 
 
445 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  44.23 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  41.67 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  40.05 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  41.67 
 
 
420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  39.63 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  42.17 
 
 
435 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  39.86 
 
 
443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  42.69 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  42.69 
 
 
435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  42.69 
 
 
435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  39.86 
 
 
440 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  38.46 
 
 
448 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  42.92 
 
 
435 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  39.52 
 
 
453 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  39.14 
 
 
431 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  42.92 
 
 
435 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.09 
 
 
430 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  40.87 
 
 
438 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  39.82 
 
 
437 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  40.14 
 
 
430 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 
443 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  40.14 
 
 
417 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  40.14 
 
 
430 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  40.14 
 
 
430 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  40.14 
 
 
430 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  40.14 
 
 
430 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  40.14 
 
 
430 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.68 
 
 
437 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  40.15 
 
 
436 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  38.14 
 
 
466 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  41.03 
 
 
430 aa  276  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  40.24 
 
 
436 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 
440 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  37.24 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  39.31 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  39.9 
 
 
436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  39.34 
 
 
437 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  40.62 
 
 
438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.44 
 
 
433 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  41.03 
 
 
425 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  39.1 
 
 
437 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  41.36 
 
 
425 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  39.17 
 
 
445 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  40.05 
 
 
436 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  40.56 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  40.56 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  40.56 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  39.57 
 
 
437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  38.54 
 
 
447 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  39.07 
 
 
428 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  39.86 
 
 
425 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  40.7 
 
 
440 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  40.39 
 
 
439 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 
443 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.78 
 
 
435 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  38.84 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  39.58 
 
 
437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  39.63 
 
 
433 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  38.95 
 
 
439 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  38.6 
 
 
428 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  40.39 
 
 
439 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5425  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 
438 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.460942  normal  0.126626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4806  MFS family transporter  47.02 
 
 
438 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  40.28 
 
 
499 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  38.6 
 
 
428 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  40.43 
 
 
430 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>